机电工程系设立于1998年，现开设工业机器人技术、城市轨道交通运营管理、智能控制技术、智能机器人技术等4个五年制高职专业，机电一体化技术、智能制造技术应用、工业机器人应用与维护、智能机器人应用与维护、智能装备工业视觉技术应用等5个技师技工专业，组建智能制造技术专业群，是江苏省技工院校品牌特色专业群，入选全国技工院校工学一体化建设专业1个，开设中德合作班，建设有国家级、省级实训基地4个。

机电工程系现有专业教师40人，其中硕士学历和高级职称占65%，拥有教学名师、全国交通技术能手、江苏工匠、省333高层次人才、江苏技能状元、江苏省技术能手等高水平师资21人。近年来共有32人次在省级及以上技能竞赛中获奖。现有在校学生2100余人。

机电工程系的校内实训基地集教学、生产、科研为一体，建有智能制造、机器人技术2个省级实训基地和工业机器人、城市轨道交通运营管理2个国家高技能人才培训基地，拥有数控车铣、电工电子、PLC、智能制造产线、工业机器人示教编程、工业机器人运维、工业视觉技术、工业控制技术、人工智能技术、城市轨道交通综合实训等20余个实训场（室），可同时容纳1200余名学生同时进行实训教学。先后与50多家大中型企业建立了长期稳定的校企合作关系，成立大亚工学院、智能制造学院2个产业学院，充分满足学生校内、外实习及就业需求。毕业生双证合格率达100%，初次就业率达99%以上。